| 先土器時代 | 遺跡名 | よみがな | 市町村（当時） | 備考 |
| 和田峠頂上遺跡・星ヶ塔遺跡・丁子沢遺跡・和田山Ⅰ・Ⅱ遺跡 | わだとうげちょうじょう・ほしがとう・ちょうじざわ・わだやま | 諏訪郡下諏訪町・小県郡和田村 | ||
| 浪人塚下遺跡 | ろうにんづかした | 諏訪郡下諏訪町 | ||
| 八島遺跡 | やしま | 諏訪市 | ||
| 茶臼山遺跡 | ちゃうすやま | 諏訪市 | ||
| 上ノ平遺跡 | うえのだいら | 諏訪市 | ||
| 踊場遺跡 | おどりば | 諏訪市 | ||
| 手長丘遺跡 | てながおか | 諏訪市 | ||
| 御座岩岩陰遺跡・琵琶石岩陰遺跡・対山館遺跡・キャンプ場遺跡・御小屋之久保遺跡 | ございわ・びわいし・たいざんかん・きゃんぷじょう・おこやのくぼ | 茅野市 | ||
| 渋川遺跡 | しぶかわ | 茅野市 | ||
| 向尾根遺跡 | むこうおね | 諏訪郡原村 | ||
| 神子柴遺跡 | みこしば | 上伊那郡南箕輪村 | ||
| 御園牧ヶ原遺跡 | みそのまきがはら | 伊那市 | ||
| 石子原遺跡・石子原古墳 | いしこばら | 飯田市 | ||
| 治部坂遺跡 | じぶざか | 下伊那郡浪合村 | ||
| 縄文時代 | 遺跡名 | よみがな | 市町村（当時） | 備考 |
| 草創期 | 曽根遺跡 | そね | 諏訪市 | |
| 向山遺跡 | むかいやま | 上伊那郡宮田村 | ||
| 増野川子石遺跡 | ましのかわごいし | 下伊那郡高森町 | ||
| 早期 | 樋沢遺跡 | ひざわ | 岡谷市・塩尻市 | |
| 細久保遺跡 | ほそくぼ | 諏訪市 | ||
| 駒形遺跡 | こまがた | 茅野市 | ||
| 判ノ木山西遺跡 | はんのきやまにし | 茅野市 | ||
| 萱野遺跡 | かやの | 上伊那郡箕輪町 | ||
| 宮の原遺跡 | みやのはら | 上伊那郡高遠町 | ||
| 三つ木遺跡 | みつぎ | 伊那市 | ||
| 舟山遺跡 | ふなやま | 駒ヶ根市 | ||
| 高見原横山遺跡 | たかみはらよこやま | 駒ヶ根市 | ||
| カゴ田遺跡 | かごた | 上伊那郡飯島町 | ||
| 立野遺跡 | たつの | 飯田市 | ||
| 前期 | 扇平遺跡 | おんびら | 岡谷市 | |
| 武居林遺跡 | たけいばやし | 諏訪郡下諏訪町 | ||
| 十二ノ后遺跡 | じゅうにのき | 諏訪市 | ||
| 神ノ木遺跡 | かみのき | 茅野市 | ||
| 下島遺跡 | しもじま | 茅野市 | ||
| 阿久遺跡 | あきゅう | 諏訪郡原村 | 国史跡 | |
| 机原遺跡 | つくえばら | 諏訪郡富士見町 | ||
| 中越遺跡 | なかごし | 上伊那郡宮田村 | ||
| 中期 | 後田原遺跡 | ごたっぱら | 岡谷市 | |
| 広畑遺跡 | ひろはた | 岡谷市 | ||
| 梨久保遺跡 | なしくぼ | 岡谷市 | ||
| 海戸遺跡 | かいど | 岡谷市 | ||
| 穴場遺跡 | あなば | 諏訪市 | ||
| 荒神山遺跡 | こうじんやま | 諏訪市 | ||
| 尖石遺跡 | とがりいし | 茅野市 | 国特別史跡 | |
| 与助尾根遺跡 | よすけおね | 茅野市 | ||
| 茅野和田遺跡 | ちのわだ | 茅野市 | ||
| 居沢尾根遺跡 | いざわおね | 諏訪郡原村 | ||
| 大石遺跡 | おおいし | 諏訪郡原村 | ||
| 徳久利遺跡 | とっくり | 諏訪郡富士見町 | ||
| 九兵衛尾根遺跡・狢沢遺跡・藤内遺跡・籠畑遺跡・新道遺跡 | きゅうべえおね・むじなざわ・とうない・かごはた・あらみち | 諏訪郡富士見町 | ||
| 曽利遺跡 | そり | 諏訪郡富士見町 | ||
| 井戸尻遺跡 | いどじり | 諏訪郡富士見町 | 国史跡 | |
| 樋口内城館遺跡 | ひぐちないじょうやかた | 上伊那郡辰野町 | ||
| 堀遺跡 | ほり | 上伊那郡高遠町 | ||
| 月見松遺跡 | つきみまつ | 伊那市 | ||
| 北丘B遺跡 | きたおかB | 伊那市 | ||
| 御殿場遺跡 | ごてんば | 伊那市 | 県史跡 | |
| 大城林遺跡 | おおしろばやし | 駒ヶ根市 | ||
| 山溝遺跡 | やまみぞ | 上伊那郡飯島町 | ||
| 尾越遺跡 | おこし | 上伊那郡飯島町 | ||
| 鳴尾天白遺跡 | なるおてんぱく | 上伊那郡飯島町 | ||
| 里見遺跡 | さとみ | 下伊那郡松川町 | ||
| 増野新切遺跡 | ましのしんきり | 下伊那郡高森町 | ||
| 鐘鋳原遺跡 | かないばら | 下伊那郡高森町 | ||
| 前の原遺跡 | まえのはら | 飯田市 | ||
| 十原遺跡 | じゅうはら | 下伊那郡南信濃村 | ||
| 後期 | 上ノ段遺跡 | うえのだん | 茅野市 | 国史跡 |
| 大花遺跡 | おおはな | 諏訪郡富士見町 | ||
| 百駄刈遺跡 | ひゃくだんがり | 伊那市 | ||
| 晩期 | 御社宮司遺跡 | みしゃぐうじ | 茅野市 | |
| 野口遺跡 | のぐち | 伊那市 | ||
| 荒神沢遺跡 | こうじんざわ | 駒ヶ根市 | ||
| 弥生時代 | 遺跡名 | よみがな | 市町村（当時） | 備考 |
| 前期 | 苅谷原遺跡 | かりやはら | 上伊那郡中川村 | |
| 林里遺跡 | はやしざと | 下伊那郡豊丘村 | ||
| 中期 | 庄ノ畑遺跡 | しょうのはた | 岡谷市 | |
| 仲浜町遺跡 | なかはまちょう | 諏訪市 | ||
| 北原遺跡 | きたはら | 下伊那郡高森町 | ||
| 寺所遺跡 | てらどこ | 飯田市 | ||
| 阿島遺跡 | あじま | 下伊那郡喬木村 | ||
| 尾之島館遺跡 | おのしまやかた | 下伊那郡南信濃村 | ||
| 後期 | 岡屋遺跡 | おかのや | 岡谷市 | |
| 橋原遺跡 | はしばら | 岡谷市 | ||
| 樋口五反田遺跡 | ひぐちこたんだ | 上伊那郡辰野町 | ||
| 北城遺跡 | きたじょう | 上伊那郡箕輪町 | ||
| 鳥井田遺跡 | とりいだ | 伊那市 | ||
| 姫宮遺跡 | ひめみや | 上伊那郡宮田村 | ||
| 的場遺跡 | まとば | 下伊那郡松川町 | ||
| 出早神社付近遺跡 | いずはやじんじゃふきん | 下伊那郡高森町 | ||
| 出原西部遺跡 | いずはらせいぶ | 下伊那郡高森町 | ||
| 月夜平遺跡 | つきよだいら | 下伊那郡高森町 | ||
| 高松原遺跡 | たかまつばら | 下伊那郡上郷町 | 現飯田市 | |
| 大門原B遺跡・座光寺原遺跡・中島遺跡 | だいもんばらB・ざこうじばら・なかじま | 飯田市 | ||
| 権現堂前遺跡・さつみ遺跡 | ごんげんどうまえ・さつみ | 飯田市 | ||
| 酒屋前遺跡・滝沢井尻遺跡 | さかやまえ・たきざわいじり | 飯田市 | ||
| 田村原遺跡 | たむらはら | 下伊那郡豊丘村 | ||
| 帰牛原遺跡 | きぎゅうばら | 下伊那郡喬木村 | ||
| 古墳時代 | 遺跡名 | よみがな | 市町村（当時） | 備考 |
| 古墳 | コウモリ塚古墳 | こうもりづか | 岡谷市 | |
| 青塚古墳 | あおづか | 諏訪郡下諏訪町 | 県史跡 | |
| 一時坂古墳 | いっときざか | 諏訪市 | ||
| フネ古墳 | ふね | 諏訪市 | ||
| 守屋山麓古墳群 | もりやさんろく | 諏訪市・茅野市 | ||
| 姥塚古墳 | うばづか | 茅野市 | ||
| 大塚古墳 | おおつか | 茅野市 | ||
| 松島王墓古墳 | まつしまおうはか | 上伊那郡箕輪町 | ||
| 飯沼雲彩寺古墳 | いいぬまうんさいじ | 下伊那郡上郷町 | 県史跡 | |
| 高岡1号古墳 | たかおか１ごう | 飯田市 | 県史跡 | |
| 新井原12号古墳 | あらいばら１２ごう | 飯田市 | ||
| 畦地1号古墳 | あぜち１ごう | 飯田市 | ||
| 妙前大塚古墳 | みょうぜんおおつか | 飯田市 | ||
| 代田1号古墳 | しろた１ごう | 飯田市 | ||
| 兼清塚古墳 | けんせいづか | 飯田市 | ||
| 塚原二子塚古墳 | つかはらふたごづか | 飯田市 | ||
| 馬背塚古墳 | ませづか | 飯田市 | 県史跡 | |
| 御猿堂古墳 | おさるどう | 飯田市 | 県史跡 | |
| 正清寺古墳 | しょうせいじ | 飯田市 | ||
| 家の上古墳 | いえのうえ | 下伊那郡豊丘村 | ||
| 郭1・2号古墳 | くるわ１・２ごう | 下伊那郡喬木村 | ||
| 遺跡 | 鬼戸窯跡 | おにど | 岡谷市 | |
| 本城遺跡・本城1・2号古墳 | ほんじょう・ほんじょう１・２ごう | 諏訪市 | ||
| 下蟹河原遺跡 | しもかにがわら | 茅野市 | ||
| 山岸遺跡・天伯A・B遺跡 | やまぎし・てんぱくA・B | 下伊那郡鼎町 | 現飯田市 | |
| 清水遺跡 | しみず | 飯田市 | ||
| 城遺跡 | じょう | 下伊那郡豊丘村 | ||
| 伊久間原遺跡 | いくまっぱら | 下伊那郡喬木村 | ||
| 神坂峠遺跡 | みさかとうげ | 下伊那郡阿智村 | 国史跡 | |
| 歴史時代 | 遺跡名 | よみがな | 市町村（当時） | 備考 |
| 大久保B遺跡 | おおくぼB | 岡谷市 | ||
| 榎垣外遺跡 | えのきがいと | 岡谷市 | ||
| 小坂城跡 | おさかじょう | 岡谷市 | ||
| 大熊城跡 | おおくまじょう | 諏訪市 | ||
| 旧御射山遺跡 | もとみさやま | 諏訪市・諏訪郡下諏訪町 | ||
| 足場遺跡 | あしば | 諏訪郡富士見町 | ||
| 中道遺跡 | なかみち | 上伊那郡箕輪町 | ||
| 箕輪遺跡 | みのわ | 上伊那郡箕輪町 | ||
| 福島遺跡 | ふくしま | 伊那市 | ||
| 寺平遺跡 | てらだいら | 上伊那郡飯島町 | ||
| 恒川遺跡群 | ごんが | 飯田市 | ||
| 松尾南の原遺跡 | まつおみなみのはら | 飯田市 | ||
| 杉の木平遺跡 | すぎのきだいら | 下伊那郡阿智村 |